此方案遭到了北京大學師生持續反對與抗議，經過一兩年後，北京大學、北京師範大學、北京女子師範大學、天津北洋大學、北京藝術專門學校、保定河北大學、天津工業專門學校、天津法政專門學校先後退出，北京師範大學、北京女子師範大學另組國立北平師範大學、保定河北大學農科改為河北省立農學院、保定河北大學醫科改為河北省立醫學院、天津工業專門學校改為河北省立工學院、天津法政專門學校改為河北省立法商學院，國立北平大學至此剩下醫、農、工、法、女子文理五個學院，國立北京大學則擁有文、理、法三個學院。
抗戰時國立北平大學、國立北平師範大學、國立北洋工學院三校內遷西安合辦國立西北聯合大學，汪精衛政權的華北政務委員會在北平開設偽北京大學（有文、理、法三個學院）及北平大學（有醫、農、工三個學院），後將北京大學及北平大學合併為偽北京大學（有文、理、法、醫、農、工六個學院），勝利後偽北京大學被改組為北平臨時大學補習班，其中：
- 偽北京大學理學院改組為第一分班
- 偽北京大學文學院改組為第二分班
- 偽北京大學法學院改組為第三分班
- 偽北京大學農學院改組為第四分班
- 偽北京大學工學院改組為第五分班
- 偽北京大學醫學院改組為第六分班
