2009年，國務院將珠海市橫琴島東部，橫琴口岸南面，與路氹城一河之隔的一幅約一平方公里土地租借給澳門特別行政區作為興建澳門大學新校區之用，並批准依澳門法律實施管轄。
新校園在2009年12月20日（澳門回歸十周年）奠基，時任中共中央總書記、國家主席胡錦濤在行政長官崔世安的陪同下出席了新校園的奠基儀式。2013年7月20日，澳門大學新校區正式使用澳門法律實施管轄，11月5日新校園正式啟用。新校區由建築師何鏡堂設計，比原校園大20倍。新校園在行政區劃上被納入氹仔，法定地址為澳門氹仔大學大馬路。
2014年5月18日，葡萄牙總統席爾瓦率團訪問澳門大學。2014年12月20日，中共中央總書記、國家主席習近平視察澳門大學，參觀大學展館和住宿式書院，讚揚澳大辦學制度理念創新。2018年4月16日，教育部向澳門大學贈送的「博雅之璧」雕塑，喻意弘揚中華優秀傳統文化和美德。
2014年9月5日，澳門郵政專門發行了澳門大學新校園郵票
