香港科技大學的辨識主要有二，分別為「香港科技大學校徽」及大學象徵「紅鳥」。香港科技大學雖在英屬香港時期創立，惟歷史較香港大學及香港中文大學短，故此沒有由英國倫敦的英國紋章院（College of Arms）授予的完整紋章（英語：Coat of Arms）。紋章是一種與校徽有關的特有設計，可用作大學辨識之用，如香港中文大學紋章。可是，香港科技大學有代表大學權力的「大學權杖」，如香港中文大學的「大學權杖」一樣，惟大多只會在畢業典禮出現。
校徽及象徵
「香港科技大學校徽」是大學的正式代表圖案，而象徵「紅鳥」並非代表大學的正式圖案，惟「紅鳥」在校園內亦被廣泛使用。
- 校徽
香港科技大學的校徽構圖簡潔、只含藍金二色，貫徹科大追尋樸實的文化一貫作風。香港科技大學在殖民地時期創校時已設有校徽，惟因歷史較短及創校時接近香港主權移交，校徽沒有如香港大學校徽和香港中文大學校徽般擁有英國大學一貫校徽風格（使用紋章之盾牌）或受其影響。科大的校徽蘊含着多個象徵意義：最頂端的金色圓形圖案代表學人的智慧，其金光映照代表香港的湛藍大海。圖案下面平放着一本打開了的書本，標誌着對知識的探索和追求。在一雙支持着這部書的胳臂中間，有一個象徵科學研究的燒瓶（flask）。它亦可以被看成傳送訊息的發射站，並作為工程學及技術發展（或通訊及管理）的表徵。全個校徽整合起來則隱隱然是一位學者的半身像。鮮為人知的是，校徽暗藏着三個希臘字母： 分別為 Upsilon、Psi 及 Tau，它們可以分別被翻譯為英文的「U」、「S」和「T」，合起來即香港科技大學的英文縮寫
科大的接近北門的入口廣場（Piazza）的迴旋處中央豎立了一件名為「紅鳥」的日晷藝術品，部分科大學生因其特殊的外貌而戲稱其為「火雞」。「紅鳥」在科大不同的出版刊物中出現，漸漸成為了科大的象徵，比科大的校徽更廣為香港人所熟悉。「紅鳥」亦在學生會、學生會屬下組織和大學屬下組織的徽號中出現，名義上可謂已經取代校徽的位置。
校訓
香港科技大學是香港唯一成立至今仍沒有正式校訓的大學，因此備受部份學生批評。由於校內設有多部升降機，而升降機旁均設有「上一層、落兩層，請使用樓梯」的牌，故有學生戲言此出現率很高的標語為校訓。另有學生認為漆於青蛙路的「希望在於人民 改變始於抗爭」十二大字廣為人所熟識、應成為科大之校訓。亦有指「求進、求新、創未來」是科大的校訓，但此並未得到學校的正式確認，且部分同學認為這不符合一般校訓的格式，亦即簡潔的中文校訓配合拉丁文校訓。
大學名稱
香港科技大學於1987年1月正式命名。時任聖保羅書院校長夏永豪等人提出之「香港科技大學」從百多個命名建議中脫穎而出，成為此大學的名稱。港科技大學一名雖能突出科大對科學與工程技術的重視，惟字面上忽略科大之商學、社會研究和人文等學科，因而被部分學生所詬病。
