校史
籌備階段
1954年，長榮中學第二任董事長任內，由陳明清、吳基福等15名董事籌組「長榮文學院」第一屆董事會，但因當時教育部對於設立大學禁令所限，未能如期進行籌設。長榮中學第三任董事長任內，設立大學的禁令尚未解除，希望先設立專科學校，但受眾議所阻。長榮中學第四任董事長任內，仍為法令所限一直停留在籌備階段。
「長榮工學院」階段
- 1985年，長榮中學第五任董事長接任時，適逢教育部解除設立私立大學禁令，遂由當時的長榮中學校長以及長榮女中董事長共同研議創設「長榮工學院」。
- 1988年3月，正式向教育部申請創辦「長榮工學院」。
- 1989年6月，獲得教育部核准籌設。同年8月成立董事會。1990年2月3日，完成財團法人設立登記。
「長榮管理學院」階段
- 1992年11月16日，長榮工學院奉准改為「長榮管理學院」。
- 1993年2月16日，財團法人「私立長榮管理學院」登記核准，同年參與大學聯招，設有資訊管理、企業管理、國際企業、會計等四學系。
- 1995年，增設醫務管理學系；翌年增設航運管理學系、土地管理與開發學系、職業安全與衛生學系、大眾傳播學系、翻譯學系及夜間部二技醫務管理技術學系。
- 1997年，增設經營管理研究所碩士班及護理學系；翌年增設財務金融學系、社會工作學系。
- 1999年，增設經營管理研究所碩士在職專班、土地管理與開發學系碩士班、媒體設計科技學系，夜間部二技醫務管理技術學系分設醫務管理組、護理管理組之分組。
- 2000年，增設翻譯學系碩士班、職業安全與衛生學系碩士班；翌年增設經營管理研究所博士班、醫務管理學系碩士班、應用日語學系、工程管理學系、視覺藝術學系，會計學系改名會計資訊學系。停招夜間部二技醫務管理技術學系。
「長榮大學」階段
- 2002年，改名為「長榮大學」，整合原管理學群、公共衛生學群、人文社會學群成立「管理學院」、「健康科學院」、「人文社會學院」。增設經營管理研究所碩士班會計財金組、資訊管理學系碩士班、視覺藝術學系碩士班、企業管理學系碩士班、日本研究所、醫學研究所（分設醫學組及護理組）、生物科技學系、呼吸照護技術學系，工程管理學系改名科技工程管理學系。
- 2003年，增設航運管理學系碩士班、經營管理研究所碩士班財務金融組、運動休閒管理學系。經營管理研究所碩士班會計財金組改名經營管理研究所碩士班會計資訊組。
- 2004年，增設護理學系碩士班及社會工作學系碩士班。
- 2005年8月1日，增設資訊工程學系。整合資訊管理學系、科技工程與管理學系、資訊工程學系成立「資訊暨工程學院」。同年9月增設台灣研究所碩士班。
- 2006年，增設國際企業學系碩士班、健康科學系、臨床心理學系。經營管理研究所碩士在職專班改名高階管理碩士在職專班。醫務管理學系碩士班分設健康產業經營與管理組、健康規劃與管理組之分組。醫學研究所、呼吸照護技術學系遷移至彰化分部。
- 2007年，增設運動休閒管理學系碩士班、生物科技學系碩士班、哲學與宗教學系。放棄彰化分部籌設案，設於分部之系所開始籌備遷回台南校本部。
- 2008年，增設基督教學系並成立基督教研修學院。彰化分部之醫學研究所、呼吸照護技術學系遷回台南校本部。
- 2009年，增設科技管理學位學程。健康科學系改名保健營養學系、臨床心理學系改名健康心理學系、視覺藝術學系改名美術學系，護裏學系碩士班改設臨床護理組、護理行政組及社區護理組。日本研究所調整為應用日語學系碩士班。
- 2010年，增設書畫藝術學位學程、學士後不動產專案管理學士學位學程。基督教學系改名神學系；基督教研修學院改名「神學院」。
- 2011年，增設休閒產業管理學士學位學程、數位內容創作學士學位學程，科技工程管理學系改名科技工程與管理學系，並停招呼吸照護技術學系。
- 2012年，醫務管理學系碩士班取消分組。
- 2013年，增設媒體設計科技學系碩士班、管理學院原住民學士專班、健康產業發展學士學位學程，運動休閒管理學系改名運動競技學系、書畫藝術學位學程改名書畫藝術學系。成立「永續教育學院」，並新設有管理學士學位學程進修學士班、藝術創意與設計學士學位學程進修學士班、語文學士學位學程進修學士班，師資培育中心裁撤。
- 2014年，增設醫學研究所臨床諮商心理學組。BIG O長大夢想空間、產學合作總中心正式啟用。
- 2015年，增設創新互動設計學士學位學程、國際會展管理學學士學位學程、國際財務與商務管理學士學位學程、台灣文化創意產業學士學位學程、環境與食品安全檢驗學士學位學程、觀光與餐飲服務事業進修學士學位學程，哲學與宗教學系改名應用哲學系、休閒產業管理學士學位學程改名觀光與餐飲管理學系。台南青年創業基地BIG O2、廚藝創能學堂正式啟用。
- 2016年，增設消防安全學士學位學程，並分設消防防災技術組、消防實務管理組。國際會展管理學士學位學程分設國際行銷貿易組、會展規劃管理組；醫務管理學系分設醫療機構組、長期照護組；生物科技學系增設生物產業經營管理組；環境與食品安全檢驗學士學位學程分設環境檢驗組、食品檢驗組、職場檢測組；社會工作學系分設社工專業組、長期照護服務管理組；媒體設計科技學系分設互動設計組、影視動畫組；創新互動設計學士學位學程分設互動多媒體組、創意美學組。數位內容創作學士學位學程改名數位內容設計學系。健康產業發展學士學位學程改名醫藥科學產業學士學位學程。資訊暨工程學院改名資訊暨設計學院。成立環境教育國際實驗學院。
- 2017年，增設綜合災害防減國際碩士學位學程、醫學社會暨健康照護學士學位學程健康照護組、醫學社會暨健康照護學士學位學程醫療社會福祉組、永續發展國際學士學位學程、東南亞文化與產業學士學位學程、資訊暨設計碩士學位學程、無人機應用學土學位學程、智慧生活應用學士學位學程、醫藥照護產業進修學士學位學程。創新互動設計學士學位學程改名互動設計學系，並設置互動裝置應用組、美學與資訊設計應用組之分組；科技管理學位學程改名創新應用管理系、經營管理研究所改名管理學院經營管理博士班/碩士班、醫藥科學產業學士學位學程改名醫藥科學產業學系。
- 2018年，醫學社會暨健康照護學士學位學程取消健康照護組、醫療社會福祉組之分組。增設蘭花產業應用學士學位學程，並分設蘭花國際行銷組、蘭花創意應用組。語文學士學位學程改名日語進修學士學位學程。同年新設安全衛生科學學院，由原隸健康科學學院之職業安全與衛生學系、環境與食品安全檢驗學士學位學程、消防安全學士學位學程共同組成，成為該校第八個學院。同年增設國際商學院，成為該校第九個學院。
- 2019年，停招台灣研究所、綜合災害防減國際碩士學位學程、應用日語學系碩士班、土地管理與開發學系碩士在職專班、醫務管理學系碩士在職專班、神學系、國際財務與商務管理學士學位學程。增設資訊暨設計學院學士班、綠能與環境資源學系。管理學士學位學程改名管理進修學士學位學程。原隸人文社會學院之美術學系暨碩士班、書畫藝術學系及台灣文化創意產業學士學位學程，整合成立美術學院，成為該校第十個學院，也是臺灣所有綜合型大學中第一個美術學院。原隸人文社會學院之媒體設計科技學系，改隸資訊暨設計學院；原隸資訊暨設計學院之無人機應用學士學位學程，改隸安全衛生科學學院。
- 2020年，停招醫藥照護產業進修學士學位學程、不動產財務金融學士學位學程、國際會展管理學士學位學程。增設職安消防進修學士學位學程、應用社會科學碩士在職學位學程。
- 2021年，停招醫學研究所、翻譯學系碩士在職專班、科技工程與管理學系、智慧生活應用學士學位學程、數位內容設計學系。媒體設計科技學系改名數位媒體設計學系。增設安全衛生科學碩士在職學位學程、安全衛生科學碩士學位學程。
