擴張時期：1994年－1997年
1994年，中華民國教育部修正《大學法》，確立「大學自治」和「學術自主」的原則，雖然當時政府對高等教育的成長仍採取緊縮政策，但教育部已對大學的管制做了相當程度的鬆綁。中華工學院向教育部提出了改名大學的申請，並投入豐沛的資源進行擴建，依教育部的要求加速建設學校
這個時期，交通大學圖書館館長林樹成為中華工學院的院長。林樹憑藉着其深厚的學術背景推動中華工學院邁向綜合大學，在此時期，學校的共同科和人文社會科學皆獲得很大的發展，通識教育中心、師培、外文系、行政系相繼成立。
1994年教育部頒佈《師資培育法》取代《師範教育法》，師資培育由計劃式培育改為儲備式培育，培育機構由原師範校院擴大為各大學校院，中華工學院在開放時也申請開設教育學程
除了新增科系，也新增了二年學制。1996年教育部核定《大學校院申請設置二年制技術院系審核要點》，開放大學附設二技，中華工學院與真理大學、淡江大學、元智大學、義守大學等19校率先將二年制技術系納入招生，以高教體系豐富的資源及設備吸引技職體系學生就讀技術系
此時期，新竹科學工業園區對高階人力的需求增多，學校入學人數在此期間顯著上升。學生人數從1993年的2,726人上升到1996年的5,540人，成長了一倍。學員急遽增長致使校舍不敷使用，於是校地開始向北、向東拓展，興建了新的教學大樓以容納逐年擴編的教學單位，董事會也積極尋覓第二校區。時至1996年，中華工學院已發展為具有19個科系、學制完整、日夜間部合5,500餘人的大型學院，擁有九幢校舍、體育場、室內運動場，並舉行了第一屆運動會。
