2007年起為參與教育部「繁星計劃」25所大學之一。自2005年起每年皆獲得教育部之「獎勵大學教學卓越計劃」補助。2006年起獲得教育部「發展國際一流大學及頂尖研究中心計劃」第一階段補助經費1.4億元，在獲補助之全國17校中金額排名第13；2008年起獲得此計劃第二階段補助經費每年0.9億元，在獲補助之全國15校中金額排名第12。2009年海大推廣產學合作獲教育部三年2700萬補助。2014年加入臺北聯合大學系統。2021年加入泛太平洋大學聯盟。
由於部分學校升格後之校名與國立臺灣海洋大學校名近似，因此自2017年5月3日起，由經濟部智慧財產局取得「國立臺灣海洋大學」、「台海大」、「臺海大」、「海大」及「校徽」圖之專用商標權利，限制日後其他大專院校不得再使用相關簡稱
