澳門大學設有人文學院、工商管理學院、教育學院、健康科學學院、法學院、社會科學學院、科技學院、人文社科高等研究院、協同創新研究院、應用物理及材料工程研究院、中華醫藥研究院、微電子研究院，以及榮譽學院和研究生院 ，開辦學士、碩士、博士等約130多個學位課程，授課語言以英語為主，部分課程以葡萄牙語、中文或日語授課。該校設有10所書院，包括曹光彪書院、鄭裕彤書院、張崑崙書院、蔡繼有書院、霍英東珍禧書院、呂志和書院、馬萬祺羅柏心書院、滿珍紀念書院、紹邦書院及何鴻燊東亞書院。
澳門大學在2022年泰晤士高等教育世界大學排名201-250，國際化發展第五，亞洲大學排名第38位，全球年輕大學排名39；在2019年亞太地區大學排名60。在Quacquarelli Symonds（QS）世界大學排名也節節上升，在2022年上升至322位。工程學、計算機科學、化學、材料科學、藥理學與毒理學、精神病學／心理學、生物學與生物化學、臨床醫學、社會科學總論、農業科學進入基本科學指標資料庫（ESI）前1%之列。
澳門大學於2016年成為首間獲澳門特區政府頒發教育功績勳章的澳門高等院校
澳門大學工商管理學院在2020年成為世界第99所、澳門首所獲得歐洲質量改善系統(EQUIS)、國際商學院聯合會認證（AACSB）、工商管理碩士協會認證（AMBA）的三重認證商學院，現今只有0.6%的商學院獲得此認證。澳大工商管理學院同時亦是歐洲管理發展基金會（EFMD）正式會員。
