1990年代初：正名
1991年，學院向香港政府申請自行評審資格及升格為大學。
1993年7月，香港總督會同行政局授予學院自行評審資格。
1994年11月25日，獲大學及理工教育資助委員會頒授自我評審資格，立法局通過《香港法例第1132章 - 香港城市大學條例》，學院獲得大學地位。(同月香港理工學院和香港浸會學院亦分別獲授大學名銜)。
大學時期發展（1994年－現在）
1997年2月，為學生推出一張全新的學生証「智城卡」，是亞洲首張雙晶片身分証及儲值現金聰明卡。
1998年，創意媒體學院及中國文化中心成立。
2000年4月，大學在校園內推出無線上網服務。
2001年5月8日，大學參與創立的「千里眼控股有限公司」（現「訊智海國際控股有限公司」，港交所：08051）在香港聯合交易所創業板正式掛牌上市，為香港首家把附屬科技初創企業上市的大專學府。
2003年8月，大學招收第一批內地自費學生。
2004年7月，香港城市大學專上學院成立。（城大專上學院於2019年7月由澳大利亞伍倫貢大學接辦，已註冊成為一所政府認可的專上學院，現為香港伍倫貢學院，完全獨立於城大以外。）
2008年3月，獲國家科技部批准，成立太赫茲及毫米波國家重點實驗室，是香港首家在工程領域方面的國家重點實驗室。
2009年，「海洋污染國家重點實驗室夥伴實驗室」成立。
第四任香港特別行政區行政長官梁振英曾為大學校董會主席。梁振英出任城大校董會主席三年期間，學校很多政策出現改變，其中最為爭議的是更改員工的聘用制度，但同時亦有人認為這些改變使大學教學質素得以提升。2018年起，政府委任黃嘉純出任香港城市大學校董會主席。
2011年1月，城大投資逾一億港元在深圳興建的產學研大樓，舉行啟用典禮。同年10月，邵逸夫創意媒體中心舉行開幕典禮。
2012年2月，學術樓（二）(現 李達三葉耀珍學術樓)慶賀落成啟用。
2013年5月，學術樓（三）(現 劉鳴煒學術樓)正式啟用。
2014年7月，為慶祝創校30周年，城大採用新徽標，由城大的英文縮寫「CityU」與數字「30」組成，表達追求行動、進步的勵志信息。其後成為大學新校徽。
2015年8月28日香港城市大學以約5.5億元，呎價逾1萬元購入丰滙基座商場。商場位於1及2座基座，地下至2樓共有3層，合共5.32萬方呎。
2018年2月，香港城市大學與廣東惠州市人民政府在惠州簽署「香港城市大學惠州校園項目落戶潼湖生態智慧區」合作備忘錄，香港城市大學將在廣東惠州擬建設佔地面積約1000畝的校園項目，並籌劃合辦動物醫療檢驗中心及食物安全實驗室。城大在2019年6月表示，得悉相關土地不適合規劃作教育用途，而惠州市政府亦因財政考慮原因未能落實之前所做的承諾，因此不會進一步探討。
2018年8月20日香港首家及唯一的動物醫學院命名為「賽馬會動物醫學及生命科學院」，學院由城大與其國際䇿略夥伴美國康乃爾大學合作於2014年建立，課程2019/20學年起獲大學教育資助委員會資助。
2020年3月，城大計劃在東莞松山湖高新技術產業開發區設校區，籌建香港城市大學（東莞），預計2023年正式開辦課程。
