歷史沿革
第一任上加拿大（今安大略省）省督約翰·格雷弗斯·閃高一直希望能建立一所殖民地學是在1798年，上加拿大執行委員會建議在當時的殖民地首都約克（位於今多倫多市）建立一所學
1827年3月15日，英國國王佐治四世正式頒佈了一份皇家特許狀，宣佈「一座擁有大學的形式和特權的學院……出於以基督教的原則教育年輕人，並引領他們步入科學及文學的諸多分支的目的……將以『國王學院』之名永遠延續。
特許狀的通過很大程度上歸功於時為加拿大聖公會多倫多教區大主教的約翰·斯特拉坎的遊說，隨後他成為多倫多大學的第一任校長。
最早的主樓是一棟約三層樓高的希臘復興式建築，坐落於現今皇后公園地界內。
在斯特拉坎的管理下，國王學院是一座與英國聖公會以及當時的當時的殖民社會上層精英聯繫密切的宗教學院。改革派政客反對教會對殖民地學術機構的掌控，而為大學的世俗化進行了激烈的爭鬥。9年，新一屆上加拿大責任政府在一場冗長而激烈的辯論後，投票決定將國王學院改名為多倫多大學，並切斷了學校與教會的聯繫。坎早就預見到了這項決定，而在一年前就辭去了校長的職位，並建立了三一學院，一座隸屬於英國國教的私立神學院。
書院便是在這時作為多倫多大學非宗派的教學分支而建立的。美國南北戰爭期間，出於北方封鎖政策對英屬北美產生的可能威脅，大學步槍兵團成立了——他們最終在1866年參與了尼亞加拉邊境上抵禦芬尼亞突襲的戰鬥。
1878年建立的「實踐科學學院」是後來應用科學與工程學部的前身 - 它從建立伊始就被給予了Skule這一暱稱，並沿用至今
醫學院在1843年成立，醫學教學自1853年起都由專科學校進行，直到1887年大學的醫學院兼併了多倫多藥學院。那期間，大學依然擔負起舉辦相關考試和授予醫學學位的職責。
學院和牙科學院也先後於1887年和1888年成立；後者將安大略省王家牙科外科學院作為其附
學自1884年開始招收女性學
1890年，一場毀滅性的大火燒毀了大學書院的內部，並將學院三萬餘本藏書化為灰燼。
如此，大學還是在兩年內修復了這棟建築，並重建了其中的圖書館。
後的二十年裏，書院聯邦制度開始成型。多倫多大學與多個教會學校逐步聯合——這其中包括當年斯特拉坎所建立的三一學院。大學於1896至1991年，及1912至1968年間分別接管了皇家音樂學院和皇家安大略博物館；後兩者如今作為獨立的機構仍與大學保留着密切的聯繫。
1年成立的多倫多大學出版社是加拿大的第一個學術出版機構；907年成立的以本哈德·菲爾諾為首的林學院是加拿大第一個致力於林業學研究的大學部門。1910年，教育部開辦了一所實驗學校，即現在的多倫多大學附屬中學。
第一次和第二次世界大戰期間，大學內的活動隨着本科及研究生大規模的積極參軍而大大減少際體育競賽及辯論社團皆被暫停 - 儘管少數展覽和部門間的體育比賽仍在舉辦。
列治文山的大衛·鄧拉普天文台於1935年成立；隨後多倫多大學航空航天研究所也於1949年成立。\1964和1967年分別建立了位於士嘉堡和密西沙加的分校。曾附屬於多倫多大學的安大略農學院和格蘭登學院從多倫多大學獨立後，於1964及1965年分別加入了貴湖大學和約克大學。自1980年起，政府撥款的削減迫使大學更加積極地尋求財政資助。\多大學是加拿大第一所募集了超過十億加幣的基金的大學\
1998年，因受到不公平待遇，地球物理學家陳建業起訴多倫多大學，索要100萬加元的賠償金，他於2000年撤訴後被復職為全職教授，並獲得了包括研究經費在內的50萬加元的補償。\017至2018年期間，多倫多大學因人權方面的問題受到學生投訴並被新聞報道，其中一起通過內部調查澄清了涉事者的嫌疑
