發布日期：2022-04-20 19:19 訪問次數：
| 任別 | 姓名 | 任期 | 備註 |
|---|---|---|---|
| 1 | 羅宗洛 |
1945年8月－1946年2月9日 1946年4月9日－1946年5月 |
代理校長，留日植物學家、中研院院士、曾任南京中央大學教授 |
| 2 | 陸志鴻 | 1946年8月13日－1948年5月31日 | 留日工學家、曾任南京中央大學工學院院長 |
| 3 | 莊長恭 |
1948年6月1日－1948年8月1日 1948年8月29日－1948年12月7日 |
第1屆中央研究院院士、留美及留德化學家、曾任南京中央大學理學院院長。莊校長在8月1日首度請辭離臺，教務長丁燮林和醫學院院長兼教務長，8月29日被慰留回到臺北，12月7日再次請辭離臺12月15日，發表傅斯年接任 |
| 代理 | 杜聰明 | 1948年12月8日－1949年1月19日 | 大清福建臺灣省臺北府淡水縣三芝人，臺灣醫師、醫學教授，京都帝國大學醫學博士，臺灣史上首位醫學博士（MD, PhD）。高雄醫學院（今高雄醫學大學）創辦人，首位臺灣大學醫學院院長兼臺灣大學教務長和代理校長。 |
| 4 | 傅斯年 | 1949年1月20日－1950年12月20日 | 第1屆中央研究院院士、留英及留德歷史學家、曾任北大代理校長。任內病逝，埋骨於台灣大學校園內之傅園。是影響台大最深遠的校長 |
| 代理 | 沈剛伯 | 1950年12月20日－1951年3月 | 留英歷史學家、曾任南京中央大學文學院院長，教務長兼任代理校長 |
| 5 | 錢思亮 | 1951年3月－1970年6月 | 中研院院士、留美化學家、曾任北大教員 |
| 6 | 閻振興 | 1970年6月－1981年8月 | 留美水利學家 |
| 7 | 虞兆中 | 1981年8月1日－1984年8月 | 土木工學家 |
| 8 | 孫震 | 1984年8月－1993年2月27日 | 留美經濟學家。因出任中華民國國防部部長而卸任 |
| 代理 | 郭光雄 | 1993年2月27日－1993年6月21日 | 留日動物學家，教務長兼任代理校長 |
| 9 | 陳維昭 | 1993年6月22日－2005年6月21日 | 留日醫學家 |
| 10 | 李嗣涔 | 2005年6月22日－2013年6月21日 | 留美電機學家 |
| 11 | 楊泮池 | 2013年6月21日－2017年6月21日 | 臺灣醫學家、中研院院士、世界科學院院士、美國國家發明家學院院士。任內重視學術倫理。 |
| 代理 | 張慶瑞 | 2017年6月21日－2017年10月1日 | 留美物理學家(IEEE Fellow、APS Fellow)、俄羅斯國際工程院院士，行政副校長兼任代理校長 |
| 代理 | 郭大維 | 2017年10月1日－2019年1月8日 | 留美資工學家(ACM Fellow、IEEE Fellow)、歐洲科學與藝術學院院士 (Member, European Academy of Sciences and Arts)、美國國家發明家學院院士(2018 NAI Fellow)，學術副校長兼任代理校長 |
| 12 | 管中閔 | 2019年1月8日－2023年1月7日 | 留美經濟學家、世界科學院院士(2014 TWAS Fellow)、中央研究院院士、曾任國家發展委員會主任委員。原定於2018年2月1日上任，但受校長遴選事件影響延至同年12月24日才獲教育部核可，2019年1月8日上任，同月15日因其任政府公職期間涉兼職遭中華民國監察院彈劾，移送公務員懲戒委員會審理後被判申誡，2021年1月17日兼任中國文化大學董事。 |
