概要
中華民國政府於第二次國共內戰失利而撤退至臺灣後，接收日本海軍第六燃料廠廠本部300公頃土地。1955年金開英擔任中油總經理，撥用40甲土地給清華大學建校，由來自中國的校長梅貽琦於新竹市主持清華在台復校。復校重建之初首設原子科學研究所，1964年恢復大學部，目前設有理學、工學、原子科學、人文社會、生命科學、電機資訊、科技管理、教育、藝術、台北政經學院TSE等11個學院，共26個一般學系、10個學士班、23個獨立研究所、17個研究中心。位於中國北京的國立清華大學則由中華人民共和國政府接管，更名為清華大學。
在學術研究上，清華自29國130所（2011年4月）增加至49國319所（2020年4月）大學保持校際合作關係，各國交換學生、外籍生、華語學習的互動熱絡。而國立清華大學也與國內的國立陽明交通大學及國立中央大學、國立政治大學三校共同組成台灣聯合大學系統，整合各校資源，共同成立研究中心。此外，復校後的清華和相鄰的交大於1969年開始固定於每年春季舉辦「梅竹錦標賽」，比賽項目包含球類、橋藝、棋類、田徑、拔河等。清華校友與許多知名大學包括台灣大學等，都有協助校友創業活動，以租用辦公室的方式，推廣其創業活動，如清華海峽研究院
根據湯森路透重要科學指標（Thomson Reuters, Essential Science Indicators，清華在化學、物理、材料科學、工程、計算機科學、生物與生物化學及臨床醫學等七學門被列為論文被引次數世界前1%之研究機構；臺灣在22個評比學門中之5個學門有研究機構躋身世界百強，清華在QS全球大學學科排名中在「材料科學」方面排名世界第37名，居全臺各校所有領域之首。2017年，於「機械工程」方面排名世界第38名，超越台大為全台第一。腦神經科學領域，諾貝爾獎得主DNA之父詹姆斯·杜威·沃森於2010年造訪清華時譽為『世界領先』。清華未來式，校園規劃，續以清華校色紫色及白色重新改造清華湖及校門口，清華湖以紫色意象傳統清華典雅，校門口以白色意象設計象徵未來醫學發展。
經費來源
1948年（民國37年），梅貽琦校長離開北平前往南京，後出國赴紐約與中華教育文化基金董事會會商清華基金保管及運用事宜，確定國立清華大學將中國對美國的庚子賠款的退款使用剩餘部分存放至美國銀行設立「清華基金」，由梅貽琦校長掌控此基金。 1949年（民國38年）中華民國中央政府遷往台北，梅貽琦校長前往臺灣新竹市復建國立清華大學，至今此基金利息仍每年由銀行撥付給國立清華大學作為開支經費，只有台灣國立清華大學接收此基金。
