董事會爭議
2016年4月11日、21日高雄醫學大學第9屆校友陳東榮、第20屆校友張建國指出，高雄醫學大學成為陳氏家族私產，陳啟川、陳田植、陳田原、陳田錨、陳建志等三代家族成員世襲高雄醫學大學歷屆董事。
2017年10月15日高醫校友總會獲知高雄醫學大學校務會議、全校學生會投票決議通過回復附設醫院名稱為「高雄醫學大學附設醫院」及通過命名「自由大樓」兩案，但執行遇到阻礙， 校友返校參與校慶時，將「高雄醫學大學附設中和紀念醫院」招牌置換為「高雄醫學大學附設醫院」、「啟川大樓」置換為「自由大樓」， 招牌由高雄醫學大學工會理事長吳國揚帶至校史館存放。
2017年8月15日監察院「106教調0034」調查報告糾正教育部，對高雄醫學大學董事會八大違法濫權處理顯有包庇未當。
2017年10月15日高雄醫學大學校友會舉行第4屆理事長、常務理監事及監事會召集人選舉，1676名校友到場投票，藍傳盛以976票當選理事，在26名理事中，藍傳盛獲得24票當選理事長。 藍傳盛聲明，新團隊將大力改革董事會。 內政部質疑：高雄醫學大學校友4萬多人，1676人出席理監事改選，出席人數未過半，選舉無效。
2017年11月1日高雄醫學大學董事會要求高雄醫學大學11月5日前恢復招牌，所需費用向損壞招牌者求償。 並要求高雄醫學大學校長劉景寬，蒐集證據、委請律師向法院控告拆除招牌者，並請求實質損害賠償及名譽損失。
2017年12月8日全球高醫大校友會聯合會發表聲明書「公開譴責立委趙天麟」指出，內政委員會立法委員趙天麟質詢內政部官員時，對高醫大校友總會理監事選舉的個案施加壓力
